Los autores coinciden en que el apellido deriva de un topónimo: se vincula con localidades como Novate Milanese o Novate Mezzola, en la zona de Sondrio, ambas en la región de Lombardia.

Se considera que estos topónimos pertenecen a la categoría de los nombres prediales, es decir, nombres que hacen referencia a propiedades o terrenos en tanto objeto de normas jurídicas o fiscales. La forma latina altomedieval praedialis deriva del latín praedium, que designaba una propiedad fundiaria. Según esta perspectiva, la raíz del topónimo Novate sería el cognomen latino Novus, por lo que la localidad habría sido originalmente la propiedad de alguien llamado así. Este tipo de topónimo aparece también en Piemonte y en el Cantón Ticino.

E. Rossoni amplía las posibilidades de origen e indica que el apellido podría derivar igualmente del nombre latino Novatianus o del tardolatín Novatius, formas personales de las que también pudo surgir el apellido por vía directa. Rossoni señala además que el apellido es propio del área que abarca las zonas de Milano, Varese y Como.