Los autores coinciden en que este apellido deriva del topónimo Ganna o Valganna, localidad de la provincia de Varese, en la región de Lombardia.

E. Rossoni aporta que el nombre Ganna estuvo en uso entre los galos Senones, pueblo de la antigüedad, entre quienes se recuerda a una madre y vidente llamada Ganna. Señala además que la transformación en apellido tiene rastros documentales desde el siglo IX, en un acto de época lombarda que menciona a un tal Iohanni qui vocatur Ganna episcopus. El apellido es propio de la zona de Varese.