Los autores difieren en el origen de este apellido. E. Rossoni propone derivaciones de antropónimos: el nombre Staneus, de origen griego aunque documentado también en época romana; el nombre medieval germánico Stannus; el gótico Stannis; o bien una forma apocopada del nombre eslavo Stanislaw. Rossoni registra la variante Stagni en la zona entre Modena, Bologna y Ferrara, con grupos también en Genova y en Trieste; mientras que la variante Stagno aparece en Sicilia —especialmente en la zona de Palermo, pero también en las zonas de Agrigento, Messina, Catania, Caltanissetta y Enna—, así como en la zona de Vibo Valentia y en la zona de Cagliari.

F. De Laurentiis propone en cambio orígenes toponímicos o descriptivos: el apellido podría derivar del topónimo Stagno, presente en las provincias de Bologna, Livorno, Parma y Cremona; del término de oficio stagnaio ("estañero"); de una referencia a lugares con pequeñas extensiones de agua poco profunda donde afloran plantas palustres; o de un apodo aplicado a una persona sólida y bien plantada.