Los autores coinciden en el origen griego del apellido. E. Rossoni señala que derivaría del término griego kalogheros, que significa "bello anciano", título reservado especialmente a frailes y personas de respeto. En algunos casos podría proceder del nombre propio griego Kalogeros, o bien de topónimos que contienen la raíz Calogero, como San Calogero en las zonas de Vibo Valentia y Agrigento, o Piano Calogero en la zona de Palermo.

P. Durante propone en cambio una etimología distinta: el griego kalos hieros, con el sentido de "buen sacerdote" o "monje", o bien su uso como nombre propio.

Rossoni documenta indicios de la transformación en apellido desde el siglo XVI en Lizzanello, en la zona de Lecce, con la forma Calogiuri, y en la segunda mitad del siglo XVIII con la variante Caligiuri. Geográficamente, la forma Caligiuri se concentra en Calabria, particularmente en la zona sur de Cosenza, Catanzaro y Crotone, mientras que Calogero predomina en el este de Sicilia y en la zona de Reggio Calabria.