El apellido presenta orígenes divergentes según los autores consultados.

E. Rossoni sostiene que en la mayoría de los casos derivaría del nombre medieval Cannonus, documentado ya en la Antigüedad con el estadista y legislador ateniense Cannonus —citado también por Jenofonte— y, en tiempos más cercanos, con el mercader y banquero del siglo XIII Cannonus de Ganducio, en la zona de Alessandria. En algunos casos, señala Rossoni, podría derivar de topónimos con la raíz Canne o Cannone. La forma Cannone se registra principalmente en Lazio, Puglia, la zona de Ascoli Piceno en Marche, la zona de Chieti en Abruzzo, la zona de Napoli en Campania y en Sicilia; la variante Cannoni aparece en la zona de Firenze, Arezzo y Siena en Toscana, en la zona de Perugia en Umbria, en Roma y en la zona de Sassari en Sardegna.

V. Blunda, en cambio, propone para la forma siciliana un origen árabe: derivaría del étimo al kanuni, con el significado de "brasero, hornillo", y habría funcionado como apodo ocupacional vinculado a oficios que empleaban fuego, o bien como apodo descriptivo alusivo a un carácter ardiente.