Los autores coinciden en que este apellido deriva del nombre personal Isidoros, de origen griego, con el significado de "don de Isis", la diosa de la maternidad y la fertilidad en la mitología egipcia, venerada también en la antigua civilización greco-romana. El nombre pasó al latín tardío como Isidorus y luego se italianizó como Isidoro. Su transformación en apellido proviene de los nombres personales de los ancestros fundadores de cada familia.

A. Bongioanni señala que el nombre fue llevado por doce santos, de los cuales los más venerados en Italia son San Isidoro de Alejandría (fallecido en 404, celebrado el 15 de enero), San Isidoro de Sevilla, Padre de la Iglesia del siglo VI (celebrado el 4 de abril), San Isidoro de Madrid (fallecido en 1170, patrono de los agricultores, celebrado el 10 de mayo), y en Venezia San Isidoro de Chío, cuyo cuerpo se conserva en la basílica de San Marco (celebrado el 14 de mayo). Bongioanni agrega que en los apellidos esta forma concurre con Teodoro.

E. Rossoni precisa que el nombre tardolatino Isidorus fue llevado, entre otros, por Sanctus Isidorus Hispalensis (aproximadamente 560–636). En cuanto a la distribución geográfica, las formas Isidor e Isidoris son casi únicas, mientras que Isidori es típico de la franja central que comprende Marche, Umbria y Lazio. La forma Isidoro presenta zonas específicas en la provincia de Pescara, en Sant'Antimo en la zona de Napoli, y en la provincia de Brindisi.