Los autores coinciden en que el apellido puede derivar del nombre personal latino de origen griego Milo (Milonis), del cual se conserva un ejemplo en un acto de mayo de 1061 del Códice Diplomático de Brescia. E. Rossoni señala que el apellido presenta dos zonas principales: una en la región de Campania, entre Napoli y Salerno, y otra en el área salentina —es decir, la zona más meridional de la región de Puglia, en el sur de Italia—, con una zona probablemente extinta en Sicilia. Agrega que en algunos casos podría derivar de un topónimo de la Magna Grecia vinculado a la isla de Milos, como la localidad Milo en la provincia de Catania, y documenta rastros de su transformación en apellido en el Archivo de Estado de Trapani, donde en el repertorio de 1440 aparece un notario llamado Francesco Milo.

V. Blunda propone en cambio una raíz germánica: el nombre personal Milo como forma hipocorística ligada a la raíz mil, con el sentido de "suave, dulce, gentil". Señala que Milo Crispín (~990–1048), conde normando de Évreux, fue uno de los primeros grandes señores de la Normandía ducal, y advierte que la asociación popular con Milo de Crotona, el célebre atleta griego del siglo VI a.C., constituye una etimología cruzada: la semejanza formal entre ambas tradiciones es resultado del azar fonético y no de un origen común.

Las variantes Milone y Milon se documentan principalmente en Campania, Sicilia y Puglia, con presencia de Milon casi exclusiva en el sur de Italia. Miloni, de aparición muy escasa, parece vinculado a Roma.