Los autores difieren en la etimología de este apellido. E. Rossoni señala que derivaría del nombre medieval Musaccus, documentado en un acto pisano donde figura un tal Ranerius Musaccus, y que su transformación en apellido está documentada en Conversano en 1709. F. De Laurentiis, en cambio, propone que en la base del apellido hay un apodo y nombre de oficio formado a partir de musacchino, término que designaba la parte de la antigua armadura destinada a proteger los hombros; alternativamente, De Laurentiis considera que podría derivar del apellido Musi.

En cuanto a la distribución geográfica, Rossoni indica que Musacchi es típico de la zona de Ferrara —específicamente en Argenta y Ferrara—, mientras que la variante Musacco se concentra en Trani y Cerignola, en la zona de Bari.